Прошел год, как люди узнали о существовании мутантов. На улицах не стихают митинги, которые говорят, что мутантов нужно уничтожить. Профессор Ксавье пытается отстоять права мутантов в суде, пока ему это не слишком удается. Создана организация S.H.I.L.D.S. Она занимается отловом мутантов и создает стражей-роботов, которым не каждый мутант может противостоять. Братство во главе с Магнето решают уничтожить эту организацию, но им это не очень хорошо удается. Братство так же нападает на невинных людей. Завязывается война между командой икс и командой Магнето.
А в отдаленной местности, где всегда царит зима процветает орг. "Оружие икс". Они тайно сотрудничают с S.H.I.L.D.S. Страйкер выводит новых мутантов, которые служат ему. Их он направляет в город, чтобы те крушили все, что попадется на глаза. Таким образом Страйкер пытается обвинить мутантов в том, что они агрессивны и их нужно убивать. Так же он нацелился на команду икс. Его планы страшны и пока ещё никому неизвестны.